פרופ’ אבנר בן-זקן הוא ראש המכון, ומרכז המחקרים על מדע ישראלי, והיסטוריה ישראלית. פרופ’ בן-זקן הוא היסטוריון של המדע, העוסק בקישוריות של אנשים ואובייקטים מדעיים תוך שהם חוצים גבולות תרבותיים. חבר סגל בכיר בקריה האקדמית אונו. ב 2004- הוא השלים בהצטיינות יתרה את הדוקטורט מ- UCLA וזכה בפרס ריינגולד (Reingold) מטעם החברה להיסטוריה של המדע (HSS). בין השנים 2004-2008 נבחר לשמש כעמית בחברת העמיתים של אוניברסיטת הרווארד (Harvard Society of Fellows). פרופ’ בן-זקן פרסם שלושה ספרים ועשרות מאמרים המאופיינים במתודולוגיה היוצאת ממיקרו-היסטוריה וההולכת ומתרחבת בהתאמה לקווי המתאר של ההיסטוריה העולמית. הוא נולד וגדל בבאר-שבע.